作者简介:郑 武(1977—),男,福建人,副主任法医师,博士,研究方向为法医遗传学。 E-mail:zhengwuz@sina.com
目的 调查D6S1043、D12S391和D1S1656 3个STR基因座在福建汉族人群中的遗传多态性。方法 应用STRtyper-21G试剂盒对福建地区400名汉族无关个体血样进行PCR扩增,经3130XL型遗传分析仪电泳检测,用GeneMapper ID V3.2软件进行等位基因分型。结果 D61S1043基因座共检出21个等位基因,D12S391基因座共检出13个基因型,D1S1656基因座共检出15个基因型。D6S1043的H值为0.877,PIC值为0.870,DP值为0.972,PE值为0.749;D12S391的H值为0.850,PIC值为0.830,DP值为0.956,PE值为0.694;D1S1656的H值为0.840,PIC值为0.810,DP值为0.952,PE值为0.674。D6S1043、D12S391、D1S1656 3个基因座DP值均大于0.9,PIC值均大于0.8,H值均大于0.8。结论 D6S1043、D12S391、D1S1656 3个基因座属于高鉴别力、高杂合度、高信息量基因座,适用于福建汉族法医学个体识别及亲权鉴定。
Objective To investigate the genetic polymorphism of 3 short tandem repeat loci (D6S1043、D12S391 and D1S1656) of Han population in Fujian, China.Methods PCR amplification and capillary electrophoresis were used to determine the genotypes of 3 STR loci for 400 non-relative individuals.Results 21 alleles were identified in D6S1043 while 13 ones in D12S391 and 15 in D1S1656. The heterozygosities of the loci D6S1043, D12S391 and D1S1656 were 0.877, 0.850 and 0.840, respectively, with polymorphic information contents of 0.870, 0.830 and 0.810, discrimination powers 0.972, 0.956 and 0.952, and probability of paternity exclusion 0.749, 0.694 and 0.674, respectively. Statistical analysis of 3 STR loci showed that their discrimination power was greater than 0.9 with both their polymorphic information content and the heterozygosity greater than 0.8.Conclusions These 3 STR loci (D6S1043, D12S391 and D1S1656) can be applied in the individual identification and paternity test in Han population of Fujian, China.
400份血样来自本实验室2013年前科违法犯罪人员库血样中福建省汉族人群无关个体。采用10μ L扩增反应体系, 其各成分配比及热循环参数参照STRtyper-21G直接扩增荧光检测试剂盒(海尔施基因科技公司)说明书, 应用ABI 3130XL基因分析仪进行STR基因座的检测与分型。用Data collection进行收集数据, GeneMapper ID V3.2软件进行等位基因分型。参照郑秀芬所述方法[1], 计算福建地区人群D6S1043、D12S391和D1S1656 3个基因座的等位基因分布频率, 以及各STR基因座的杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、个体识别能力(DP)。
福建汉族人群3个STR基因座的等位基因及基因频率见表1。D61S1043共检出21个等位基因, D12S391共检出13个基因型, D1S1656共检出15个基因型。3个STR基因座在汉族群体中的多态性及其遗传学应用参数见表2。
与福建汉族人群其余15个STR基因座[2]的个体识别力及非父排除率相比, D6S1043、D12S391、D1S1656等STR基因座具有较高的个体识别力及非父排除率。D12S391、D6S1043的非父排除率比福建地区其余15个STR基因座都高。D6S1043个体识别力较福建人群其余15个基因座的个体识力高; 除了比D2S1338、D18S51、D8S1179、FGA的个体识别力略低外, D12S391、D1S1656较福建人群其余11个STR基因座的个体识别力高。
尽管赖力等[3]对福建汉族人群D6S1043、D12S391等两个基因座多态性分布情况也开展了相关分析, 但其结果与本研究结果相比, 基因型较少, 且DP、H、PE、PIC均更低, 其可能性为分析的群体大小差异, 赖力等仅以102份样品作为分析群体, 其代表性有限。Gill等将DP≥ 0.9, H≥ 0.7, P≥ 0.7的基因座作为高鉴别能力的遗传标记物[4], 从表2可见, D6S1043、D12S391、D1S1656等3个基因座均DP> 0.9, PIC> 0.8, H> 0.8, 表明它们属于高鉴别力、高杂合度、高信息量基因座, 该三个基因座在国内其它地区的研究结果[5, 6, 7, 8, 9, 10]相似, 极具应用价值。本调查研究结果显示, D6S1043、D12S391、D1S1656 3个基因座适用于福建汉族法医学个体识别及亲权鉴定。
The authors have declared that no competing interests exist.
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